以文本方式查看主题 - 中文XML论坛 - 专业的XML技术讨论区 (http://bbs.xml.org.cn/index.asp) -- 『 生物信息学 』 (http://bbs.xml.org.cn/list.asp?boardid=46) ---- ===数据格式问题=== (http://bbs.xml.org.cn/dispbbs.asp?boardid=46&rootid=&id=61259) |
-- 作者:dongyikun -- 发布时间:4/12/2008 3:51:00 PM -- ===数据格式问题=== 我从DBTSS数据库下载的启动子数据(promoter) 数据格式如下: 1,1 389834 1 3 NM_001013655 chr4_random 0 736550 1 1 1 822589 735715 AACTGACCTCCACTTATCTTGCTGCCTGGATTGGCATACATATTCCTCTGCCTGAAAAATTGCTCAATACTTTTGAAAGGTTGTTTCTCACTGTTACACCCAGGCATTTCTGCTAACACCAGCTGAGTTGTAAGGGGCCCTCCAGGAGACCTAGGTTGTTCTCCTTATCACATACATTATTTTCATTTATCAATTTACCCAGAACATCTAATGAAATATTATGGACACCAATAACATGAATACAAATATAGCTATAGACCCTAAAAAGTAAATTGATGTCTCTTGAAAGGCTGTCATGTCTTAGATGCTAAATTTGGAGTATGTGTTTGTAATAAATAAATAGCTTGCTTTAATAATTCTGATTTATGAATGTAATATAGGGGAGCAGCTTTTATTTCGCCCTTAATCTTAAAaaacaattagctgggtgtggtggtgggcacctgtagtcccagctactcaggaggctgaagcaggaggatggtgtgcacctgggaggcggagcttgcagtaagccaaaattgtgccactgcactccagcctgagtgacagtgtgagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGATCATACATGGAGTAAATGATGATTTAGCATAAAACACAACTTTAGCCTAAAATACAGATCATAGGGCTCAAACTTTGTTATTTTATGGGATTATACTAATCAGTTAATATTCAAAATTTACCATTTCAAAAGAAGAAATATTGGTCAGGGAAAATTGCCATTGCTTATACAGAAGAATGGAGGAATCTTTTTGACAACAACAATTCTAGTGATCTTCCTCATCACTGGTTCCAAAACCAAGCCCATGGAAGGTCTGCATAGGGATAATGTGGAGAACATGCAAGAGAAATACACATCACCAGCTCCTCAACTCAGAGCTCCAAGGGAATGGCCAAGGAAGCTGTATTGTCCTAAGAAATTTGAGACTGTTTTGACTTACAATAAATCCTGCTCAATCATATGTATGTATACACACACACACAACCACACACACAGACGGTGTTGTCAGTGAAGCCTCTAACAATGCATCTTGACTGGACAGATTTGACAATTAAAATGGCTGGAAGAAAATAGGCTTCATAAGTGTCACTTACTATTCACATTACACATTAAAAGGACATCTCCTAAATTAAATCTTGTCTATGATAAAAAGGCAGAAAATCATGACCCA 此格式非fasta格式(开头少了一个”>“) 如何将此格式的大量数据转化为fasta格式? 或者直接读入matlab? |
-- 作者:riverlee2008 -- 发布时间:4/17/2008 11:49:00 PM -- 用Bioperl或Biojava吧,多学点没坏处的 |
-- 作者:dongyikun -- 发布时间:4/18/2008 10:30:00 AM -- 谢谢了 |
-- 作者:hust512 -- 发布时间:3/1/2009 3:24:00 PM -- 哈哈,没看懂! 走过留痕! |
-- 作者:zhyyjj_811 -- 发布时间:9/20/2009 7:38:00 PM -- 跟我一起学perl吧 |
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