BLAST Server安装的步骤(1)             

发信人: hek (hek重出江湖！), 信区: Bioinformatics
标  题: BLAST Server安装的步骤(1)
发信站: 北大未名站 (2001年09月14日16:02:04 星期五), 站内信件

目前的BLAST主要有两个版本：NCBI BLAST & WU BLAST。
前者不用多说，大家肯定都使用的很多，而后者可能有些同学会感觉比较陌生。
WU-Blast 是Washington University开发的Blast程序包，现在提供2.0版，在
http://blast.wustl.edu/
可以免费获得该软件包。
http://www.ebi.ac.uk/就在使用WU-Blast2.0作为Blast Server。相比NCBI，
WU-Blast可能缺少的只是一些PSI-Blast的功能，而单从Blast的运行效率和
正确性而言，可能会比NCBI Blast有过之而无不及。——当然，这只是个人的
感觉，没有什么科学的根据，因为对于这种比对的程序来说，什么是对的，什么
是不对的，本来就没有什么分明的标准。
NCBI的Blast包下载网址为：
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/
它最大的特点是提供了许多新的功能，如PSI-Blast等等，据说是采用新的递归
等算法——sorry,我对算法不感冒，具体的就不知道了，谁了解再补充补充？
而且NCBI的Blast还提供现成的网络界面和程序接口。安装极为方便。
在北大生物信息的FTP上，你可以轻松获得这两个版本的BLAST程序包。
虽然Blast可以轻松运行于Windows 9X系统下的，但是要想架设一个Blast Server。
最好还是要用Linux下的版本——当然有Sun服务器，用Solaris版本也是很不错
的主意。

——今天就先说这么多吧，在瞿博的办公室 里，不宜多说。呵呵
听着老外侃大山，好玩。
--
        ◢█◣◢█◣
        ██████
我的    ◥████◤     永远属于你！
          ◥██◤
            ◥◤
                                                        

※ 修改:·hek 於 09月14日17:05:48  修改本文·[FROM: 162.105.78.194]
※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 162.105.16.227]