新书推介:《语义网技术体系》
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    发贴心情 BLAST Server安装的步骤(1)


    BLAST Server安装的步骤(1)             


    发信人: hek (hek重出江湖!), 信区: Bioinformatics
    标  题: BLAST Server安装的步骤(1)
    发信站: 北大未名站 (2001年09月14日16:02:04 星期五), 站内信件


    目前的BLAST主要有两个版本:NCBI BLAST & WU BLAST。
    前者不用多说,大家肯定都使用的很多,而后者可能有些同学会感觉比较陌生。
    WU-Blast 是Washington University开发的Blast程序包,现在提供2.0版,在
    http://blast.wustl.edu/
    可以免费获得该软件包。
    http://www.ebi.ac.uk/就在使用WU-Blast2.0作为Blast Server。相比NCBI,
    WU-Blast可能缺少的只是一些PSI-Blast的功能,而单从Blast的运行效率和
    正确性而言,可能会比NCBI Blast有过之而无不及。——当然,这只是个人的
    感觉,没有什么科学的根据,因为对于这种比对的程序来说,什么是对的,什么
    是不对的,本来就没有什么分明的标准。
    NCBI的Blast包下载网址为:
    ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/
    它最大的特点是提供了许多新的功能,如PSI-Blast等等,据说是采用新的递归
    等算法——sorry,我对算法不感冒,具体的就不知道了,谁了解再补充补充?
    而且NCBI的Blast还提供现成的网络界面和程序接口。安装极为方便。
    在北大生物信息的FTP上,你可以轻松获得这两个版本的BLAST程序包。
    虽然Blast可以轻松运行于Windows 9X系统下的,但是要想架设一个Blast Server。
    最好还是要用Linux下的版本——当然有Sun服务器,用Solaris版本也是很不错
    的主意。

    ——今天就先说这么多吧,在瞿博的办公室 里,不宜多说。呵呵
    听着老外侃大山,好玩。
    --
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    我的    ◥████◤     永远属于你!
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                ◥◤
                                                            

    ※ 修改:·hek 於 09月14日17:05:48  修改本文·[FROM: 162.105.78.194]
    ※ 来源:·北大未名站 bbs.pku.edu.cn·[FROM: 162.105.16.227]


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    第十二章第二节《用Restlet创建面向资源的服务》
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    [InfoQ文章]解答有关REST的十点疑惑

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